研究背景:

        目前肾透明细胞癌(ccRCC)的诊断还没有准确的血清学标记。诊断和肾切除术的决策还依赖于并不非常准确的影像学方法。因此目前非常急需非侵入性的诊断标记。

 

研究方法:

       在这个研究中,我们通过定量蛋白质组学的方法,用iTraq进行同位素标记,并进行LC-MS/MS分析。我们分析了总计199个病人,包括30个匹配的正常肾和ccRCC样本的蛋白表达差异。

 

研究结果:

       研究发现在ccRCC样本中有55个蛋白的表达量与正常肾组织有显著差异(如下图所示)。其中54个蛋白曾经被报导在癌变过程中发挥作用,有39个蛋白是分泌蛋白。失调的蛋白中,alpha-enolase (ENO1), L-lactate dehydrogenase A chain (LDHA), heat shock protein beta-1 (HSPB1/Hsp27), 10 kDa heat shock protein, mitochondrial (HSPE1)的差异在另外两组独立病人中应用Western blotIHC得到验证。用PCR进行的信号通路分析验证表明,葡萄糖代谢在ccRCC病人中相比正常肾组织有所改变。作为备选的诊断标记,我们检查了Hsp27在血清和尿液中的变化。在ccRCC病人中,Hsp27在血清和尿液中显著升高,Hsp27的升高与肿瘤的等级有关。

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研究结论:

这些数据显示揭示了ccRCC癌变过程的机制,并发现了潜在ccRCC诊断标记Hsp27。当然作为诊断标记还需要大规模样本的验证。蛋白谱数据也为发现新的治疗提供的重要线索。

 

邦菲说:

这篇文章的思路是典型的iTraq发现Biomarker的策略。如下图所示,分别取病人正常肾组织和ccRCC组织进行iTraq标记及LC-MS/MS分析,得到差异基因,并进行生物信息学分析。得到备选基因以后取病人的组织,血清和尿液进行验证。得到证实的差异蛋白再用常规的Western和免疫组化进行分析,最后得到了可靠的Biomarker

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邦菲可以提供除IHC以外的全部实验,包括iTraq,生物信息分析(聚类图,信号通路分析等),WesternqPCR验证。

 

Reference List

Quantitative proteomic analysis reveals potential diagnostic markers and pathways involved in pathogenesis ofrenal cell carcinoma. 

Oncotarget. 2014 Jan;5(2):506-18.

 

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